原来人的免疫力，并不是从营养中直接获得的，而是依靠人体内外的各种抗原刺激，激发机体免疫系统产生的。这些抗原中包括各种病原微生物（如病毒、细菌等）的组成成分和代谢物。没有它们的刺激，人体就不能获得特异性的免疫力。当极少量的细菌、病毒反复刺激机体后，这些免疫系统就会针对它们产生相应的特异性抗体和致敏淋巴细胞，当有大量的细菌、病毒侵入时，就可以迅速动员，做到针对性防御。
在这里，这些极少量的细菌、病毒相当于给人体起了打“疫苗”的作用。如果人体的内外环境长期处于“干净”状态，一方面不能动员人体的正常防御系统，另一方面人体的防御系统长期处于“休眠”状态也会造成免疫功能紊乱，导致不识别“侵入者”或者“敌我不分”，造成各种错误的免疫排斥、抑制、过敏等。我们老祖宗的“不干不净，吃了没病”的说法，它的核心就是饮食不要太讲究，这样反而能维护我们的健康。这和我们现代免疫学理论是相通的，是可以科学解释的。
当然，不干不净，不是说腐败变质的食品也能吃，而是说日常的食品不必做到无菌的清洁程度，不要太刻意地去没完没了的清洗、消毒，有些人爱干净爱到了洁癖的程度，对食物清洁的要求到了苛求的地步，这样并不好。当然，也不要走到另外一个极端，把“不干不净，吃了没病”当做不讲卫生的借口，刻意地去不干净，为了不干净而不干净，这也是不可取的。